При поверненні надміру сплачених податкових зобов’язань з ПДВ, зарахованих до бюджету з рахунка платника податку в СЕА ПДВ у порядку, визначеному п. 2001.5 ст. 2001 ПКУ, такі кошти, як обумовлено п. 43.41 ст. 43 ПКУ, підлягають поверненню виключно на рахунок платника в СЕА ПДВ, а за його відсутності на момент звернення платника податків із заявою на повернення надміру сплачених податкових зобов’язань з ПДВ чи на момент фактичного повернення коштів — шляхом перерахування на поточний рахунок платника податків в установі банку.
Пунктом 2001.4 ст. 2001 ПКУ визначено, що на рахунок у СЕА ПДВ платника зараховуються кошти:
З рахунку у СЕА ПДВ платника перераховуються кошти до державного бюджету в сумі податкових зобов’язань з ПДВ, що підлягає сплаті за наслідками звітного податкового періоду, та на поточний рахунок платника податку за його заявою, яка подається до контролюючого органу у складі податкової звітності з ПДВ, у розмірі суми коштів, що перевищує суму задекларованих до сплати до бюджету податкових зобов’язань та суми податкового боргу з податку (п. 2001.5 ст. 2001 ПКУ).
Пунктом 2001.5 ст. 2001 ПКУ встановлено, що за підсумками звітного податкового періоду відповідно до задекларованих в податковій декларації результатів платником проводиться розрахунок з бюджетом у порядку, визначеному статтями 200 та 209 ПКУ.
Як визначено п. 2001.3 ст. 2001 ПКУ, складовою формули обчислення реєстраційної суми в СЕА ПДВ є сума поповнення електронного рахунку (∑ПопРах), що є загальною сумою поповнення з поточного рахунку платника податку рахунку в системі електронного адміністрування податку.
Таким чином, суми коштів, що перераховуються з бюджету платнику податку на його рахунок в СЕА ПДВ, не враховуються в обрахунку показника ∑ПопРах та не збільшують реєстраційну суму в СЕА ПДВ, оскільки це не передбачено нормами ПКУ.